在尼雅遗址中，文献和考古学的发现丰富了人们对尼雅河历史的知识。有关整个汉代的两部书——《汉书》和《后汉书》都提到塔里木盆地南缘一个叫做“尼雅古国”的“国家”。20世纪初，中国学者王国维和英国人斯坦因，都将此“国”比定在尼雅河流域的尼雅遗址。在当地发现的一枚汉文木简上也写有“汉尼雅王”的字迹。这是尼雅河真正的“历史”的开端，从此以后这个地方开始有文字了。

       自《汉书》以来，汉文史籍记载都很贫乏，而且是人云亦云，对我们来讲都不足以复原此一时期尼雅河的历史。对中国历史学研究来讲，尼雅遗址是一个“悖论”或挑战，它超出了传统中国历史和历史研究的“框架”，也超出了传统史学家的“常识”，对于考古学来讲，不啻是天赐的机缘，可以找到用武之地了。

张骞出使西域图（来源：新疆文物保护网）

       在《汉书•西域传》中直接描述了这个时期的塔里木盆地“南道”绿洲国家的一些情况。从这个时候起，我们要旅行的那个古代世界——尼雅古国就要开始登场了。

       “尼雅国，国王驻尼雅城，距离长安八千八百二十里。人口四百八十户，三千三百六十人，其中具有战斗能力者五百人。设置有尼雅都尉、左右将军、译长各一人。北距西域都护治所二千七百二十三里，南距戎卢国四日的行程。地形崎岖。西通扜弥四百六十里。”

       史书记载，大约从公元2世纪末或公元3世纪初期开始，在盆地里出现了兼并。有几个势力大的国家，像鄯善、莎车、于阗和北道的龟兹、焉耆等，逐渐地兼并了它们周围弱小的国家，形成了几个更大规模的绿洲王国。根据史书记载，尼雅古国被并入了鄯善国的版图。